شناسایی نقش TMEM100 در تنظیم نفوذ ایمنی و ساخت شبکهای از RNA اندوژن در سرطان پروستات از طریق تحلیل فراسرطانی
TMEM100 یک پروتئین غشایی است که برای رشد عروقی، به ویژه در تنظیم رگزایی، بسیار مهم است و در مسیر سیگنالینگ BMP9/10 نقش دارد. همچنین با تعدیل تعامل بین کانالهای یونی TRPA1 و TRPV1 در نورونهای حسی، نقش مهمی در احساس درد ایفا میکند و یک هدف بالقوه برای درمان درد و بیماریهایی مانند هیپرتروفی قلب و فیبروز کبد است.
آدنوکارسینومای پروستات (PRAD) یکی از تومورهای شایع دستگاه ادراری است که علت آن همچنان ناشناخته باقی مانده است. در حالی که پروتئین تراغشایی ۱۰۰ (TMEM100) نقشهای متنوعی در انواع مختلفی از سرطانها ایفا میکند، نقش آن در سرطان پروستات هنوز مورد بررسی قرار نگرفته است. در این مطالعه، هدف ما روشن ساختن تأثیر TMEM100 بر تشخیص و پیشرفت سرطان پروستات است.
با استفاده از دادههای پایگاه TCGA، توالیهای mRNA، اطلاعات بالینی و دادههای متیلاسیون مورد تجزیهوتحلیل قرار گرفتند. تحلیل پیشآگهی با استفاده از پایگاه GEPIA انجام شد و نوموگرام با بهرهگیری از بسته "rms" در نرمافزار R توسعه یافت. حساسیت دارویی از طریق بسته "pRRophetic" ارزیابی شد. ارتباط میان TMEM100 و نفوذ سلولهای ایمنی با استفاده از پایگاههای TIMER و TISDIB بررسی گردید. سطوح متیلاسیون با استفاده از زبان برنامهنویسی Perl و نرمافزار R ارزیابی شد. شبکه RNA اندوژن رقابتی (ceRNA) با استفاده از پایگاه starBase ساخته شد. آزمونهای عملکردی از جمله qRT-PCR، آزمونهای CCK8، EdU و IHC برای ارزیابی نقش TMEM100 در PRAD به کار رفتند.
بیان TMEM100 در بافتهای سرطان پروستات به طور معناداری کمتر از بافتهای نرمال بود و با پیشآگهی نامطلوب در PRAD ارتباط داشت. نوموگرام حاصل از مدل چندمتغیره، دقت پیشبینی PFI را بهبود بخشید. علاوه بر این، گروه با بیان پایین TMEM100 مقادیر IC50 کمتری برای چندین داروی شیمیدرمانی نشان دادند. TMEM100 با انواع مختلفی از سلولهای ایمنی، عوامل تنظیمکننده ایمنی و کموکاینها بهطور قابلتوجهی مرتبط بود و اثرات ضدتوموری از خود نشان داد. سطوح متیلاسیون بالاتری از TMEM100 در PRAD مشاهده شد و جایگاههای CpG خاصی با آن ارتباط آماری معناداری داشتند. هایپرمتلاسیون TMEM100 با نفوذ ایمنی در سرطان پروستات مرتبط بود. علاوه بر این، یک شبکه ceRNA مرتبط با TMEM100 در PRAD ساخته شد که نقش این ژن را از طریق آزمایشهای عملکردی تأیید کرد.
کاهش بیان TMEM100 از طریق تعدیل نفوذ ایمنی و مکانیسمهای اپیژنتیک، با پیشآگهی نامطلوب و تکثیر سلولهای توموری در PRAD ارتباط دارد.
ارسال نظر