حذف مکرر CHD1 در مردان آفریقایی-آمریکایی مبتلا به سرطان پروستات با پیشرفت سریع بیماری مرتبط است

تکنولوژی ریزآرایه زمینه تجزیه و تحلیل بیان ژن با توان عملیاتی بالا را امکان پذیر می کند به نحوی که استفاده از داده های ریز آرایه سبب فهم بهتر مکانیسم های مولکولی و معماری ژنتیکی در دهه گذشته شده است. هدف این مطالعه تجزیه و تحلیل مقایسه ایی داده های ریزآرایه دو لاین سلولی سرطان پروستات LNCap و PC-۳ برای شناسایی نشانگرهای زیستی بالقوه سرطان پروستات به شیوه ای سیستماتیک و قدرتمند می باشد. مجموعه داده ریزآرایه GSE۱۳۱۳۱ مشتمل بر ۲ رده سلولی LNCaP و PC-۳ از پایگاه داده بیان ژن GEO انتخاب و با استفاده از ابزار آنلاین GEO۲R آنالیز شدند. تجزیه و تحلیل هستی شناسی ژن (GO) و غنی سازی ژن ها در مسیر KEGG با استفاده از پایگاه داده حاشیه نویسی، تجسم و کشف یکپارچه (DAVID) انجام شد و با استفاده از پلاگین Cytohubba ژن های اصلی دارای تعاملات زیاد (هاب ژن های اصلی) شناسایی شدند و در نهایت ماژول های اصلی اثر گذار مشخص شدند.
در این مطالعه که در کشور آمریکا انجام شده است ، دادههای ژنومی سرطان پروستات مردان آفریقایی و اروپایی آمریکایی را تجزیه و تحلیل شد تا تفاوتهایی را که به نابرابری نژادی دخیل در نتیجه درمان کمک میکند، شناسایی شد. همچنین مطالعات مبتنی بر FISH را در مورد از دست دادن پروتئین متصل شونده به (CHD1) روی ریزآرایههای بافت سرطان پروستات انجام شد. همپنین مدل های سلولی سرطان پروستات با فقدان CHD1 برای تجزیه و تحلیل ژنومیکس، حساسیت دارویی و نوترکیبی همولوگ (HR) ایجاد گردید. حذف ساب کلونال CHD1 در تومورهای پروستات آمریکایی آفریقایی تبار تقریباً سه برابر بیشتر از مردان اروپایی آمریکایی بود و با پیشرفت سریع بیماری مرتبط است. حذف CHD1 با جهش های مرتبط با کمبود HR که توسط تشکیل کمپلکس RAD51 شناسایی شد، مرتبط نبود. این مشاهده با افزایش متوسط حساسیت اولاپاریب و تالازوپاریب با چندین رده سلولی کمبود CHD1 که حساسیت تالازوپاریب را در محدوده غلظت مرتبط بالینی نشان میدهند، سازگار بود. این یافته ها بیان می کند که از دست دادن CHD1 ممکن است در پیامد بدتر بیماری در مردان آفریقایی آمریکایی دخیل باشد.
ارسال نظر