تحلیل ناقل پراکسیزومی ABCD3 به عنوان عامل پیشآگهی در کارسینوم سلول روشن کلیه
کارسینوم سلول روشن کلیه (ccRCC) یکی از ۱۰ سرطان شایع در ایالات متحده است. با وجود شدت و ماهیت تهاجمی آن، نشانگرهای زیستی که بتوانند بهعنوان عوامل پیشآگهی و پیشبینیکننده برای ccRCC عمل کنند، هنوز شناسایی نشدهاند.ABCD3،یک ناقل اسید چرب زنجیرهبلند در پراکسیزوم، پیشتر بهعنوان یک عامل پیشآگهی در سرطانهای پروستات و کولون معرفی شده است. بنابراین، این مطالعه با هدف بررسی این موضوع انجام شد که آیا ABCD3 ، که در بافتهای کلیه بهطور قابل توجهی بیان میشود، میتواند بهعنوان یک نشانگر زیستی برای سرطان کلیه نیز مطرح باشد یا خیر. برای بررسی سیستماتیک ارتباط بین بیان ژن و پروتئین ABCD3، ریزمحیط ایمنی و پیامدهای بقاء در ccRCC، از روشهای بیوانفورماتیک و رنگآمیزی ایمنوهیستوشیمی استفاده شد. دادهها بهطور گسترده از پایگاههای عمومی از جمله اطلس ژنوم سرطان (TCGA)، UALCAN، Gene Set Cancer Analysis، UCSC Xena و سایر پایگاههای داده استخراج گردید.
تحلیلهای رایانهای از پایگاه TCGA نشان داد که سطح رونوشتها و پروتئین ABCD3 در تمامی تومورها و مراحل بهطور معنیداری کاهش یافته است (p<0.001).
علاوه بر این، کاهش بیان ABCD3 با کاهش بقاء بیماران مرتبط بود. تحلیلهای ایمنوهیستوشیمی و پایگاه داده CPTAC نشان دادند که ABCD3 در بیماران ccRCC بهطور معنیداری کاهش یافته است (p<0.05).
تحلیل رگرسیون کاکس چندمتغیره نشان داد که بیان ABCD3 یک عامل مستقل برای بقاء کلی بیماران است .یافتههای ما نشان میدهد که ABCD3 یک نشانگر زیستی جدید برای ccRCC است و کاهش بیان ABCD3 و سایر اعضای مسیر اکسیداسیون اسیدهای چرب زنجیرهبلند در پراکسیزومها ممکن است ویژگی مولکولی منحصربهفردی در ccRCC باشد.
ارسال نظر